Генетическое разнообразие представителей рода Acinetobacter (Proteobacteria) из кишечника байкальского омуля Coregonus migratorius (Georgi, 1775)

Авторы

  • Деникина Н.Н. 1 ID
  • Белых О.И. 1 ID
  • Суханова Е.В. 1 ID
  • Потапов С.А. 1 ID
  • Краснопеев А.Ю. 1 ID
  • Ханаев И.В. 1 ID
  • Аношко П.Н. 1 ID
  • Дзюба Е.В. 1 ID
    • 1 Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук, ул. Улан-Баторская, 3, Иркутск, 664033, Россия

DOI:

https://doi.org/10.31951/2658-3518-2025-A-2-222

Ключевые слова:

генетическое разнообразие, Acinetobacter, Coregonus migratorius, высокопроизводительное секвенирование

Аннотация

Впервые проведен анализ генетического разнообразия представителей рода Acinetobacter (Moraxellaceae, Pseudomonadales, Gammaproteobacteria) в микробных сообществах кишечника байкальского омуля селенгинской популяции. Весь массив данных, полученных с использованием высокопроизводительного секвенирования, содержал 2,9% последовательностей гена 16S рРНК (18 ASV), принадлежащих роду Acinetobacter. Филогенетический анализ показал, что используемый фрагмент гена 16S рРНК не позволил разрешить таксономическую идентификацию до вида. Не смотря на формирование устойчивых кластеров, они содержали набор различных видов рода. Наличие среди обнаруженных Acinetobacter условно патогенных видов, таких как A. lwoffii, A. johnsonii и A. pittii и отсутствие у рыб признаков заболеваний свидетельствует о благоприятных экологических параметрах среды обитания байкальского омуля на местах зимовки в пелагиали озера Байкал.

Загрузки

Опубликован

22.04.2025

Выпуск

2025: №2 (Апрель)

Раздел

Статьи

Лицензия

Copyright (c) 2025 Лимнология и биология пресноводных экосистем

Лицензия Creative Commons

Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial» («Атрибуция — Некоммерческое использование») 4.0 Всемирная.

Creative Commons License
Эта работа распространяется под международной лицензией Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0.