Характеристика бактерий класса Saccharimonadia в озерах Байкал и Хубсугул: таксономическое и функциональное разнообразие

Аннотация

Ультрамелкие бактерии повсеместно распространены в окружающей среде, однако некоторое время они оставались в стороне от научного фокуса. Среди причин можно выделить их малый размер. Ультрамикробактерии, которые определяются как бактерии с объемом клетки менее 0,1 мкм³, могут проходить через фильтр с размером пор 0,2 мкм. Кроме того, есть ряд сложностей, сопряжённых с их культивированием, на данный момент удалось получить чистые культуры, но, в основном, доминирующих филумов, редкие представлены лишь единичными штаммами. При этом ультрамикробактерии обнаружены в широком спектре сред, а их высокоупорядоченные, небольшие геномы и уникальные экофизиологические особенности привлекают все большее внимание исследователей. Развитие метагеномики позволяет частично преодолеть барьер, связанный с ограничениями в культивировании, и рассмотреть в данной статье метагеномные сборки, полученные из образцов воды крупнейших олиготрофных озер Земли – Байкала и Хубсугула. В данном исследовании проведен таксономический и функциональный анализ реконструированных геномов бактерий класса Saccharimonadia (филум Patescibacteria), который призван расширить наши знания о редких представителях микробных сообществ и дополнить уже имеющиеся сведения информацией об обитателях древнейших экосистем.