Лимнология и биология пресноводных экосистем
Цели Сетевое издание предоставляет возможность быстро публиковать оригинальные научные работы, посвященные исследованиям биотических и абиотических компонентов внутренних водоемов. Хотя большинство тематик издания относятся к изучению озер, мы также готовы рассматривать статьи, связанные с исследованиями экосистем рек, болот и водохранилищ. Тематики сетевого издания гидрологические, гидрохимические и геохимические аспекты водных экосистем; молекулярная и классическая биология экосистемных исследований; систематика и экология водных экосистем; естественное и антропогенное водействие на водные системы и ресурсы; палеолимнология и история развития окружающей среды; полевые и лабораторные исследования, моделирование.
Эта работа распространяется под международной лицензией Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0.
Палеогидролия Манычского пролива хвалынского бассейна Каспия в позднем плейстоцене
В статье рассматриваются дискуссионные вопросы палеогидрологии Манычского пролива — ключевого звена в системе водообмена между хвалынским бассейном Каспия и новоэвксинским бассейном Чёрного моря в позднем плейстоцене. Основное внимание уделено двум параметрам: максимальному уровню хвалынской трансгрессии и высоте порога стока через Манычскую впадину. На основе геолого-геоморфологического анализа, цифрового моделирования рельефа и гидравлического моделирования в системе HEC-RAS автором реконструированы сценарии сброса каспийских вод через Манычскую долину. Результаты моделирования позволили установить, что наиболее вероятный максимальный уровень Каспия во время раннехвалынской трансгрессии составлял около 40 м н.у.м. при пороге стока в 31 м н.у.м. Также рассчитаны гипотетические пределы пропускной способности русла Манычского пролива Хвалынского бассейна Каспия. Результаты могут быть использованы в дальнейших исследованиях.
Copyright (c) 2026 Лимнология и биология пресноводных экосистем https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
Проблемы биологических инвазий в рыбной фауне южного Вьетнама: пример бассейна реки Донгнай
Биологические инвазии рыб являются одними из ключевых факторов трансформации пресноводных экосистем, особенно в регионах с интенсивным развитием аквакультуры и высоким антропогенным давлением. Целью данного исследования было оценить масштабы интродукции и степень натурализации чужеродных видов рыб в бассейне реки Донгнай (южный Вьетнам), а также выявить закономерности их пространственного распределения и основные пути интродукции. Отбор ихтиологических проб проводился в апреле-мае 2025 года на 56 станциях, расположенных в верхнем и среднем течении реки Донгнай, включая реки Даньим и Даданг, их притоки и стоячие водоемы в провинциях Донгнай и Ламдонг. В общей сложности на 13 из 17 обследованных участков было зарегистрировано 17 чужеродных видов рыб. Наибольшее разнообразие интродуцентов наблюдалось в крупных водоемах, подверженных значительному антропогенному воздействию, особенно в озере Чиан (11 видов), а также в среднем течении реки Даньим и водохранилище Дайнинь (по 6 видов в каждом). Количество видов-вселенцев было значительно ниже в высокогорных районах Центрального нагорья (1–3 вида), а в водоемах национального парка Каттьен они не были зарегистрированы. Большинство видов демонстрировали низкую или умеренную частоту встречаемости; однако два из них — гуппи (Poecilia reticulata Peters, 1859) и нильская тилапия (Oreochromis niloticus (Linnaeus, 1758)) — были очень широко распространены. Полученные результаты указывают на существенный масштаб биологических инвазий в бассейне реки Донгнай. Аквакультура и аквариумная торговля являлись основными источниками интродукции чужеродных видов рыб, а их пространственное распределение было тесно связано с уровнем антропогенного воздействия и типом водоема.
Functional digestive morphology and feeding intensity of the halfbeak Zenarchopterus clarus (Hemiramphidae) in a tropical estuarine habitats, southern Vietnam
This study examines the functional digestive morphology and feeding intensity of the halfbeak Zenarchopterus clarus (Hemiramphidae) in a tropical estuarine habitats of southern Vietnam. A total of 892 specimens were collected monthly from August 2024 to July 2025 at two estuarine sites. The species exhibited a superior mouth with an elongated lower jaw, dense conical dentition, well-developed pharyngeal tooth plates, and numerous gill rakers. The digestive tract consisted of a muscular esophagus and a short intestine, lacking a clearly differentiated stomach, indicating rapid processing of soft prey. Feeding intensity was evaluated using the gut-somatic index (GI) and analyzed with generalized linear mixed models. The model indicated significant variation in GI (p < 0.001). The GI differed significantly between sexes and sampling locations, with higher values in females and at Dam Doi. Although the season had no significant main effect, a significant sex × season interaction indicated contrasting seasonal feeding patterns between males and females. Morphological traits and GI collectively suggest that Z. clarus is adapted for surface-oriented feeding on small, mobile prey in dynamic estuarine environments. However, the feeding strategy was inferred from morphological traits and GI, as diet composition was not directly examined. These findings provide baseline insights into the digestive morphology and feeding ecology of an estuarine hemiramphid fish.
A decade of Philippine freshwater goby research (2010–2022): a systematic review and meta‑analysis of ichthyofaunal surveys
Freshwater goby (Family Gobiidae) is one of the diverse and widespread fish species in rivers and lakes, with economic values ranging from ornamental and subsistence provisions. Several ichthyofaunal surveys have been conducted in the Philippines; however, no systematic review and meta-analysis was performed to analyze freshwater goby species richness over fish species richness. Following the PRISMA Protocol, twenty–three (23) studies were assessed and statistically analyzed using JASP Version 0.18.3. Each paper was reviewed to identify study sites, goby genera, diversity indices (Shannon, Pielou’s evenness, and Simpson), and physicochemical parameters, with correlations analyzed across fish species, goby species richness, and diversity indices. Results revealed that most freshwater goby studies take place in Luzon, and the genus Glossogobius is the prevalent goby species at most study sites. The diversity index for introduced fish species ranged from low to medium, as indicated by the enriched biodiversity index score from Guerrero (2014). In terms of physicochemical parameters, all values generally met the standards set by DAO 2016-08. However, the forest plot revealed that the effect size was entirely on the positive side of zero, with a combined effect size of 0.46, suggesting a moderate impact. The funnel plot indicated an asymmetrical pattern among studies, suggesting potential publication bias. Analysis suggests that goby diversity in the Philippines is high in terms of species richness, with a moderate effect size when compared to overall fish species richness based on the collated studies. Taking into account the high publication bias observed, we recommend including more studies from Southeast Asian countries. Researchers are encouraged to prioritize biodiversity studies in the Visayas and Mindanao regions to mitigate study bias. A comparative analysis of native and introduced fish species richness would also be beneficial in determining their potential impact on the overall effect size of species richness.
Assessment of water quality and zooplankton community structure in the Gambhiri River (Chittorgarh, Rajasthan, India)
This study examines water quality parameters and zooplankton community structure in the Gambhiri River, Chittorgarh district of Rajasthan, India, to assess the ecological health and trophic state of this vital freshwater ecosystem. Seasonal sampling was conducted from January to December 2023 at six sampling sites to observe spatial and temporal variations in physicochemical parameters and zooplankton communities. Key water quality parameters, including water temperature, pH, total dissolved solids, turbidity, electrical conductivity, total hardness, chloride, alkalinity, dissolved oxygen, and biological oxygen demand, were measured using standard analytical techniques. Zooplankton samples were collected with a plankton net, preserved, and identified to the lowest possible taxonomic level, following standard keys. In the study period, 65 species of zooplankton were analyzed, of which 26 species of Rotifera, 25 species of Cladocera, 8 species of Copepoda, and 6 species of Ostracoda were recorded. Cladocera appeared as the dominant group of zooplankton with a higher density (38.67%), followed by Rotifera (35.72%), Copepoda (18.57%), and Ostracoda (7.03%). The season-wise zooplankton analysis revealed that Cladocera and Rotifera were the dominant groups across all seasons, while Copepoda and Ostracoda contributed comparatively less to the total density. Cladocera showed higher density than Rotifera during summer and post-monsoon seasons, whereas during monsoon and winter, Rotifera slightly dominated over Cladocera. Copepoda consistently remained the third dominant group in all seasons, while Ostracoda recorded the lowest density throughout the study period. The study highlights the importance of zooplankton as sensitive bioindicators for evaluating the health of freshwater ecosystems and recommends routine monitoring and pollution control measures to preserve the ecological integrity of this crucial water resource in Rajasthan’s semi-arid region.
Seasonal dynamics of rotifer community in relation to water quality at Pravara-Godavari river confluence (Ahmednagar, MS, India)
This study reports the diversity, abundance, and seasonal dynamics of the rotifer community in the Pravara-Godavari river confluence, Ahmednagar, throughout a year, from November 2024 to October 2025. Seasonal sampling was conducted to assess rotifer species composition and density, and to measure key physicochemical water parameters, including temperature, pH, dissolved oxygen, turbidity, alkalinity, hardness, and chloride. A total of 19 rotifer species, representing 4 genera and 3 families, were recorded in the study area. Strong temporal variation in population structure was indicated by the rotifer community’s noticeable seasonal variations in both species richness and density. The summer period recorded the highest rotifer diversity and abundance. At the same time, the monsoon season had the lowest values, perhaps due to a dilution effect, increased water turbulence, and altered habitat stability. Furthermore, correlation analysis showed that important physicochemical parameters such as pH, water temperature, turbidity, alkalinity, total hardness, chloride concentration, and dissolved oxygen had a significant impact on rotifer species richness. These results demonstrate that even small changes in water quality can significantly impact the composition of rotifer communities. Overall, the study highlights rotifers’ sensitivity to environmental factors and underscores their value as reliable bioindicators for evaluating freshwater ecosystems.
Морфологические и генетические особенности рачков Artemia parthenogenetica и A. tibetiana (Crustacea, Anostraca) в разнотипных гипергалинных озерах юга Западной Сибири
Изучены современные морфологические характеристики партеногенетических и двуполых популяций артемии в 10 разнотипных гипергалинных озерах юга Западной Сибири (Алтайский край). ДНК-баркодинг этих популяций позволил выявить два вида артемии: Artemia parthenogenetica Barigozzi, 1974 и A. tibetiana (Abatzopoulos et al., 1998). Исследования проводили ежемесячно, с июля по сентябрь 2025 г. С помощью метода главных компонент показаны различия гидрохимического состава рапы озер, в которых обитают партеногенетические и двуполые популяции артемии. Сравнительный анализ морфологических признаков показал, что самки A. parthenogenetica и A. tibetiana имеют значимые отличия средних величин – 14 из 16 признаков. Кластерный анализ 12 пластических и 4 меристических признаков самок A. parthenogenetica показал, что её популяции разделяются на 3 группы, которые различаются особенностями строения фурки: длиной (fl), количеством щетинок (sf), длиной щетинок (sl). Индекс корреляции Спирмена выявил значимые статистические зависимости морфологических признаков A. parthenogenetica и A. tibetiana от основных экологических факторов – минерализации и температуры рапы.
Особенности накопления полихлорированных бифенилов в байкальских рыбах (первые результаты)
Впервые проведен подробный систематический анализ содержания полихлорированных бифенилов (ПХБ) в различных видах байкальских рыб. Определены уровни накопления индикаторных и диоксиноподобных ПХБ в мышцах пяти видов байкальских коттоидных рыб семейства Cottidae: Limnocottus pallidus, Limnocottus godlewskii, Asprocottus platycephalus, Leocottus kesslerii и Cottocomephorus comephoroides, и двух видов семейства Coregonidae: Coregonus baiсalensis и Coregonus migratorius. Выявлены особенности аккумуляции загрязнителей различными видами рыб в зависимости от их приуроченности к биотопам и пищевой специализации. Рассчитаны суммарные токсические эквиваленты диоксиноподобных ПХБ, концентрации которых в воде озера Байкал крайне низки.
Copyright (c) 2025 Лимнология и биология пресноводных экосистем https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
Вертикальное распределение концентрации растворенного метана в осадках фоновых районов озера Байкал
Впервые получены и обобщены вертикальные распределения концентраций растворённого метана в донных отложениях фоновых районов южной, средней и северной котловин озера Байкал вплоть до 3-х метровых глубин осадочного чехла. Вертикальные профили содержания метана на всех станциях имеют сходные черты и характеризуются низкими концентрациями в приповерхностных слоях (не превышающими 1–2 мкМ) и устойчивым ростом содержания метана с глубиной. Максимальные концентрации метана в толще осадка отмечены в средней котловине, несколько меньшие — в южной и на порядок меньшие — в северной котловине. Экспоненциальное снижение концентрации метана в отложениях при приближении к границе дно–вода к одинаково малым значениям независимо от его содержания в толще осадка свидетельствует о его существенном окислении и, как следствие, минимальном влиянии на концентрации метана в придонной воде. Полученные результаты восполняют пробел в знаниях о вертикальном распределении растворённого метана в осадках озера Байкал, и важны для оценки устойчивости углеводородных систем и механизмов их функционирования в условиях холодноводного глубоководного пресноводного водоёма.
Хлоропластный геном штамма BAC9706 Chlorella vulgaris, выделенного из озера Байкал
В настоящей работе представлена полная последовательность хлоропластного генома зелёной микроводоросли Chlorella vulgaris штамма BAC9706, выделенного из озера Байкал. Хлоропластный геном представляет собой кольцевую молекулу ДНК длиной 161 721 п.н. и содержит 78 белок-кодирующих генов, 33 гена тРНК и 3 гена рРНК. Сравнительный анализ выявил высокий уровень консервативности генного состава и порядка генов по сравнению с другими штаммами C. vulgaris, при этом незначительные различия в основном связаны с интронами и некодирующими областями. Филогенетический анализ, основанный на конкатенированных белок-кодирующих генах хлоропластного генома, показал, что штамм BAC9706 группируется внутри клады C. vulgaris с высокой бутстреп-поддержкой. Полученные результаты указывают на то, что BAC9706 представляет собой байкальский экотип C. vulgaris, а не новый вид.
Методические аспекты оценки коэффициентов естественной смертности байкальского омуля: на примере селенгинской популяции
Научная статья посвящена критическому анализу методов оценки мгновенного коэффициента естественной смертности (MКЕС) байкальского омуля Coregonus migratorius (Georgi, 1775) в контексте управления его промысловым запасом. На основе данных по росту и возрастной структуре была проведена параметризация уравнения Берталанфи. Сравнительный анализ существующих оценок MКЕС, используемых в материалах ОДУ за 2017–2025 гг., выявил их значительную вариативность, приводящую к расхождениям в расчётной биомассе популяции в три раза при равном пополнении. Важным фактором, определяющим динамику численности и биомассы поколений, является экстремально высокая посленерестовая смертность (>90%) у селенгинской популяции. Обоснована применимость теоретических моделей, основанных на инвариантах жизненного цикла в расчетах средних значений МКЕС (Jensen, 1996) исходя из концепции максимального возраста (Шибаев, 2023). Полученная на базе максимального возраста оценка Mср=0.19 год⁻¹ и соотношение M/K≈1.5 дают более реалистичные прогнозы, согласующиеся с историческими данными промысла. Критерием достоверности любых методов оценки MКЕС должна выступать их согласованность с ключевыми популяционными показателями с учётом пространственной гетерогенности стада.
Унификация геолого-геофизических характеристик гидратоносных структур оз. Байкал
Проведена унификация геолого-геофизических характеристик гидратоносных структур озера Байкал. Для этого была собраны и проанализированы все имеющиеся на данный момент времени первичные и обработанные данные. Детально изучено более 400 сейсмоакустических профилей, 50 сонограмм гидролокатора бокового обзора, 60 участков рельефа дна данных многолучевого эхолота и более 1000 первичных описаний кернов донных отложений. В результате определены 6 опорных (модельных, образцовых) гидратоносных структур (2 грязевых вулкана, 2 гидратных холма и 2 сипа), которые наиболее полно характеризуют каждый из перечисленных их типов. Унификация характеристик гидратоносных структур озера Байкал и выделение опорных структур упростит исследования уже известных и поиск новых мест с содержанием в донных осадках приповерхностных газовых гидратов.
Идентификация и комплексная характеристика нового почвенного штамма каротиногенной микроводоросли Chlorosarcinopsis sp. VKM Al-296 (Chlorophyta)
Проведено комплексное исследование нового штамма зеленых микроводорослей VKM Al-296, выделенного из пахотной почвы. На основе молекулярно-филогенетического анализа последовательностей 18S рДНК и ITS2, а также данных световой и сканирующей электронной микроскопии штамм идентифицирован как Chlorosarcinopsis sp. (Chlamydomonadales, Chlorophyta). Изучены его морфология, рост и каротиногенез в условиях двухстадийного накопительного культивирования. Установлено, что в жидкой среде клетки размером 3-6 мкм присутствовали поодиночке или в пакетах, окруженных внеклеточной слизью. К концу «зеленой» стадии (вегетативный рост) преобладающим пигментом был лютеин, составляющий более 60% от общего количества каротиноидов. Также присутствовали другие первичные каротиноиды: бета-каротин (14,6%), неоксантин (11,1%) и антераксантин (7,1%). В конце «красной» стадии (вторичного каротиногенеза) содержание сухой биомассы в культуре составляло 1,92±0,04 г/л, при этом каротиноиды составляли 0,3% от сухой биомассы. В пигментном профиле преобладали кетокаротиноиды: астаксантин (моно- и диэфиры), кантаксантин и моноэфиры адониксантина (35%, 21% и 20% от общего содержания каротиноидов, соответственно). За весь период культивирования (17 суток) средняя продуктивность культур по биомассе и общая продуктивность по каротиноидам составляли 0,10 г/л/сут и 0,2 мг/л/сут, соответственно. Chlorosarcinopsis sp. штамм VKM Al-296 может стать перспективным объектом дальнейших исследований, направленных на оптимизацию условий культивирования, в качестве источника лютеина на «зеленой» стадии, а также кантаксантина и эфиров астаксантина и адониксантина на «красной» стадии.
Нанопластики как субстрат для роста гриба Lecanicillium coprophilum (Cordycipitaceae, Hypocreales)
Антропогенное загрязнение окружающей среды пластиковыми отходами представляет собой одну из наиболее серьезных экологических проблем. Особую опасность представляют нанопластики — частицы размером менее 1000 нм, так как из-за своих малых размеров и высокой удельной поверхности для них характерна высокая биодоступность и токсичность для широкого круга гидробионтов. Многообещающими кандидатами для очистки загрязненных экосистем являются грибы, так как они обладают метаболическими возможностями для расщепления сложных молекул. В данной работе впервые экспериментально изучена способность микромицета Lecanicillium coprophilum использовать наночастицы синтетических полимеров — поливинилхлорида (ПВХ), полистирола (ПС) и полиметилметакрилата (ПММА) — в качестве субстрата для роста. С помощью флуоресцентной микроскопии и учета концентрации полимеров в среде доказано, что данный гриб способен не только адсорбировать нанопластики на поверхности своих гиф, но и вовлекать их в свой метаболизм. Непараметрический дисперсионный анализ (критерий Краскела-Уоллиса) выявил статистически значимые различия накопления биомассы мицелия в среде с разными пластиками при 10°C. Наиболее благоприятным субстратом для роста L. coprophilum оказался ПС. Медианные значения биомассы мицелия демонстрируют устойчивое ранжирование полимеров по степени благоприятности: ПС > ПММА > ПВХ, сохраняющееся при различных температурах культивирования. Также в работе обсуждается ферментативная активность L. coprophilum и возможный вклад ферментов, в частности липаз, в биодеградацию нанопластика данным видом гриба.
Краситель на основе кумарина для прижизненного окрашивания клеточных культур
Флуоресцентные красители находят широкое применение в современных биохимических и биологических исследованиях, позволяя, в частности, оценивать функциональное состояние клеток, клеточных компонентов, тканей и организмов. Красители с синей флуоресценцией обладают преимуществом, поскольку их свечение не перекрывается с автофлуоресценцией биологических сред в зелёно-красной области спектра. Целью данного исследования было создание нового доступного синего флуоресцентного красителя, способного проникать в живые клетки. Полученный краситель ZS-833 сочетает в своей структуре синий флуорофор 7-(диэтиламино)кумарин с диметил-2-бутендиоатом. Для оценки возможностей ZS-833 им окрашивали и гетеротрофные, и содержащие собственные пигменты клетки (дрожжи Saccharomyces cerevisiae и динофлагелляты Gymnodinium corollarium). Показано, что ZS-833 способен быстро проникать в оба варианта живых клеток, придавая им яркое свечение в синей и зелёной области спектра. При этом мертвые клетки не окрашивались. Полученные данные позволяют рассматривать ZS-833 в качестве перспективного агента для прижизненного окрашивания клеточных культур и, визуализации клеточных компонентов, в особенности неполярно заряженных.
Геномные основы деградации тканей байкальских губок за счет свободно живущих флавобактерий с локусами утилизации полисахаридов, ориентированными на гликаны хозяина
В данной работе мы представляем полную последовательность генома штамма Flavobacterium sp. PLB03, выделенного из культуры клеток примморф губки Lubomirskia baikalensis, и сравниваем его с патогенными и свободно живущими представителями рода Flavobacterium. Штамм Flavobacterium sp. PLB03 проявляет выраженную литическую активность в отношении клеток губки, а также вызывает гибель симбиотических микроводорослей (Trebouxiophyceae). Геном Flavobacterium sp. PLB03 имеет длину 5 925 828 п.н. и содержание ГЦ 34,3%. Средняя идентичность нуклеотидов (ANI) 98,9% показала, что штамм Flavobacterium sp. PLB03 имеет наибольшее сходство с Flavobacterium CSZ. Сравнительный геномный анализ штамма и филогенетически родственного рода Flavobacterium показал, что изолированный штамм Flavobacterium sp. PLB03 имеет большой размер генома, характерный для экологического рода Flavobacterium, а соотношение генов пептидаз и гликозидгидролаз составляет 1.8, что позволяет предположить, что штамм Flavobacterium sp. PLB03 обладает характеристиками, сходными с непатогенными штаммами.
Слабоосновный флуоресцентный краситель для прижизненной окраски кальциевых структур в живых организмах
Прижизненные красители, способные окрашивать формирующиеся скелетные элементы из карбоната или фосфата кальция, содержат карбоксильные группы, способные к взаимодействию с ионами кальция. Данные красители востребованы как в исследованиях механизмов биоминерализации, так и при введении меток в рыб и моллюсков при экологических и аквакультурных экспериментах. В то же время, молекулы красителей, несущие отрицательный заряд, например, кальцеина, плохо проникают через клеточные мембраны, что приводит к необходимости использования высоких концентраций, вызывающих токсические эффекты и неспецифическую окраску. В данной статье разработан эффективный метод синтеза нового флуоресцентного красителя QE2, содержащего слабоосновную аминогруппу и две карбоксильные группы в форме метиловых эфиров, способных к гидролизу в слабощелочной среде или под действием ферментов. Флуоресценция QE2 и продукта его гидролиза существенно зависит от полярности среды, усиливаясь в неполярном окружении с одновременным смещением испускания из зелёно-голубой в синюю область. Краситель способен легко проникать в живые клетки, что показано на примере культуры динофлагеллят. Культивирование организмов с кальциевыми скелетами (гастроподы, рыбы) в присутствии QE2 приводит к флуоресцентному окрашиванию зон роста (устья раковин гастропод, элементы скелета и плавников рыб). Краситель QE2 может найти применение для отслеживания зон кальциевой минерализации, оценки полярности клеточных органелл, введения меток в рыбы для экспериментов в области экологии и аквакультур, окрашивания клеточных культур и скелетных элементов для исследования методом конфокальной микроскопии.
Morphometric analysis of selected claw traits in Tubuca forcipata (Ocypodidae) from Southern Vietnam
A total of 233 specimens of the fiddler crab Tubuca forcipata (189 males and 44 females) were collected monthly from intertidal mudflats in Dam Doi and Hoa Binh, Ca Mau Province, Southern Vietnam, from July to October 2025. Selected morphometric traits, comprising the carapace width left-to-right (CWL–R), the carapace width right-to-left (CWR–L), the manus widths (MW2 and MW3), the pollex width (PW5), and the dactyl width (DW7), were measured to 0.01 mm. Generalized linear models with a gamma distribution and log link were used for trait comparisons; cheliped traits were analyzed with sex and the carapace width (CWL–R or CWR–L) as predictors. The carapace width did not differ by sex (p > 0.05), whereas MW2, MW3, PW5, and DW7 were significantly larger in males after adjusting for the carapace width (βsex = 0.156–0.257; rate ratios (RR) = 1.17–1.29; p < 0.001). The carapace width had strong positive effects on all cheliped traits (βCW = 0.054–0.070; RR ≈ 1.06–1.07; p < 0.001). Model diagnostics showed χ²/df < 1, indicating no overdispersion. These results demonstrate pronounced sex-linked functional dimorphism in the chelae of T. forcipata despite similar overall body size, providing a quantitative morphometric baseline for ecological and evolutionary studies of mangrove crabs in the Mekong Delta.
Влияние объема пробы и количества прочтений на результат секвенирования микроэукариотического сообщества из олиготрофного озера
Микроэукариоты играют ключевую роль в водных экосистемах и являются эффективными индикаторами их состояния. Изменения в их численности или разнообразии могут говорить об изменениях в среде обитания. В последние годы, помимо классических методом микроскопии, для мониторинга микроэукариот начали применять метод ДНК метабаркодирования. Для оптимизации метода метабаркодирования актуально установить необходимый объем отобранного образца и глубину секвенирования. В данной работе проведен сравнительный анализ образцов с разным объемом отфильтрованной пробы (50 л, 10 л и 1.2 л), а также разной глубиной секвенирования и влияния этих факторов на разнообразие и таксономический состава сообщества одноклеточных микроэукариот в олиготрофном озере Байкал. Тест ANOSIM показал сходство образцов с разными отфильтрованными объемами. То есть даже небольшого объема пробы для фильтрования (1.2 л) хватает, чтобы выявить высокое разнообразие таксонов, сопоставимое с разнообразием при фильтровании большого объема, 50 л. При большом объеме отфильтрованной пробы по результатам метабаркодирования наибольшее количество прочтений относилось к представителям Ciliophora. Диатомовые и зелёные водоросли были лучше детектированы при меньшем объеме – 10 л и 1.2 л, поэтому для мониторинга микроводорослей этого объема достаточно. Сравнение образцов с разной глубиной секвенирования показало сходные результаты в характеристике доминирующих видов. Разница проявляется в минорных таксонах, некоторые из которых выявлялись только при большем количестве прочтений. Полученные результаты важны для оптимизации мониторинга олиготрофных водоемов с применением метода метабаркодирования.
Influence of sex and body size on selected morphometric traits of Metopograpsus frontalis (Miers, 1880) from Southern Vietnam
A total of 167 specimens of Metopograpsus frontalis (105 males and 62 females) were collected monthly from intertidal mudflats in Ganh Hao, Ca Mau Province, Southern Vietnam, from July to October 2025. Selected morphometric traits, including carapace width from left to right (CWL–R), carapace width from right to left (CWR–L), manus width (MW2, MW3), pollex width (PW5), and dactyl width (DW7), were measured with a 0.01-mm vernier caliper. Generalized linear models were fitted to evaluate the effects of sex and body size, using Gaussian models for CW and Gamma models with a log link for MW, PW, and DW. We found no significant sex-related differences in CWL–R and CWR–L (p > 0.05), whereas MW2, MW3, PW5, and DW7 were significantly larger in males (p<0.001). Sex coefficients (β=0.156–0.257) corresponded to rate ratios (RR) of 1.17–1.29, indicating that male claws were 17–29% larger after adjusting for CWL–R and CWR–L. Both CW variables had strong positive effects (β=0.054–0.070; RR=1.06–1.07; and p<0.001). All Gamma models showed χ²/df<1, confirming good model fit without overdispersion. These results provide quantitative evidence of sex-related variation in morphometric traits of M. frontalis and establish a morphometric baseline for future ecological and evolutionary studies of mangrove crabs in the Mekong Delta.
Биоразнообразие и структура сообществ зоопланктона обводненного карьера Янтарный (Калининградская область, Россия)
С целью изучения биоразнообразия и количественного развития зоопланктона в 2011 и 2023-2024 гг. были проведены исследования обводненного карьера Янтарный Калининградской области. Данный водный объект благодаря своему карьерному происхождению имеет достаточно большую площадь водной поверхности и значительную глубину. В результате исследования был проведен гидрохимический анализ вод, определен таксономический состав сообществ зоопланктона, их количественные показатели, рассчитан индекс видового разнообразия Шеннона для участков водной поверхности с макрофитами и для открытой водной поверхности. Установлено, что по количеству обнаруженных видов, численности и биомассе в карьере преобладают ветвистоусые ракообразные (Cladocera). Несмотря на малую площадь проективного покрытия водной растительностью, видовое разнообразие выше в зарослях макрофитов и достигается за счет большего числа видов коловраток (Rotifera), а также зарослевых видов, характерных для данных биотопов. В карьере Янтарный были отмечены низкие показатели смертности зоопланктона, что свидетельствует о создавшихся в нем благоприятных условиях для существования планктонных сообществ, что подтверждается и результатами анализа гидрохимического состава вод, согласно которым данный водоем является олигосапробным.
Органическое вещество и биогенные элементы в воде озера Глубокого (Московская область)
По данным мониторинга 2019-2025 гг. рассмотрен современный режим показателей содержания органических и биогенных веществ в воде озера Глубокого, которое расположено в природном заказнике Московской области и может рассматриваться как фоновый водоем (получено, что максимальное содержание азота и фосфора в нем в разы ниже, чем в Можайском водохранилище, и в десятки раз ниже, чем в московском озере Белом). Показана существенная межгодовая изменчивость гидроэкологического состояния озера (в годы с неполной весенней циркуляцией летом развивается наиболее острая аноксия, и у дна накапливается примерно вдвое больше минерального азота, фосфора и окрашенных соединений железа, чем в остальные годы) при отсутствии направленного тренда в режиме биогенных веществ за всю историю исследований, а органических – с 1960-х гг., когда в результате мелиоративных работ на водосборе их содержание в озере снизилось примерно вдвое. Это ставит под сомнение существующую гипотезу о постепенном эвтрофировании озера Глубокого.
Assessing the effects of dietary and waterborne commercial salt on the performance and welfare of common carp
This study investigated the effects of salt additives in water and diet on the physiological and health parameters of common carp (Cyprinus carpio L.). Fingerlings (~50 g) were divided into seven groups: a control group (G1), three water treatment groups (G2A–C; 4, 8, and 12 g L⁻¹ salt), and three diet treatment groups (G3A–C; 5, 10, and 15 g kg⁻¹ dietary salt). All fish were fed a standard diet containing 28% crude protein at 3% body weight per day. Results revealed that G1 had the highest values for lymphocyte and monocyte counts, mean corpuscular hemoglobin (MCH), mean corpuscular volume (MCV), cholesterol, triglycerides, low-density lipoprotein cholesterol (LDL), albumin, total protein, and several somatic indices. G2B exhibited significantly higher potassium and sodium levels, while G3A showed elevated white blood cell (WBC), granulocytes, liver enzyme activities (Alanine aminotransferase activity (ALT), aspartate aminotransferase activity (AST)), creatinine, glucose, chloride, and various somatic indices. G2A and G2B groups had increased red blood cells (RBC), hemoglobin, hematocrit, and body weight index. The findings indicate that using 12 g L⁻¹ salt in rearing water and 15 g kg⁻¹ salt in the diet can enhance growth and health performance in Cyprinus carpio. This study provides important insights into salt-induced physiological responses in carp and offers practical recommendations for aquaculture practices.
Trophic structure and functional feeding groups of macroinvertebrates in a section of the Gallinazo tropical stream
Aquatic macroinvertebrates play crucial roles in ecosystem processes such as grazing, decomposition, and mineralization. Classifying these organisms into functional feeding groups (FFGs) enables a more comprehensive understanding of energy and matter flow through trait-based approaches, complementing traditional taxonomic methods. The study analyzed the trophic structure and FFG variation of aquatic macroinvertebrates in a section of a tropical stream, located in the municipality of Aguachica, Colombia. Sampling was carried out during the rainy season in May and the dry season in July 2024, during which the composition and abundance of macroinvertebrate feeding groups were analyzed. Physical and chemical parameters were measured both in situ and ex situ at strategically selected stations based on accessibility and location. Macroinvertebrates were collected using Surber and D-type nets and identified to the family level. They were then assigned to functional feeding groups. Ecological indices and multivariate statistical analyses were applied to evaluate ecosystem attributes. Results revealed seasonal variations in water parameters, including lower dissolved oxygen and higher chemical oxygen demand during the dry season, suggesting potential organic pollution. Macroinvertebrate richness was higher during the dry season, with Caenis sp. and Tanypodinae sp. being dominant, while Drepanotrema sp. and Physa sp. were more abundant during the rainy season, reflecting eutrophic conditions. The P/R index indicated heterotrophic dominance, and low CPOM/FPOM ratios pointed to limited riparian cover. These findings underscore the importance of implementing conservation strategies to mitigate anthropogenic pressures and preserve the ecological integrity of freshwater ecosystems.
Изменчивость плодовитости пеляди Coregonus peled (Gmelin, 1789) Средней Оби (Западная Сибирь) и влияние на нее температуры окружающей среды
Пелядь Coregonus peled – широко распространенный представитель сем. Coregonidae в Северной Евразии, численность которого до сих пор относительно высока на всех участках бассейна Оби. Вид отличается экологической пластичностью, его плодовитость варьирует в очень широких пределах, различаясь как в разных водных объектах, так и в одном и том же в разные периоды наблюдений. Известно, что на воспроизводительную способность данного вида оказывает влияние гидрологический режим – в многоводные годы она выше. Целью данной работы был анализ плодовитости пеляди, поднимающейся для естественного воспроизводства в пределы Средней Оби, и поиск связи ее колебаний с температурой среды. Выявлено, что половая зрелость среднеобского стада пеляди начинает наступать в трехлетнем возрасте, однако его основу составляют пяти–шестилетние экземпляры, суммарно составляющие до 70 % производителей. Показатели воспроизводительной способности вида весьма изменчивы. Индивидуальная абсолютная плодовитость составляет от 11,3 до 58,0 тыс. икринок, увеличиваясь с возрастом, промысловой длиной, общей массой, массой тела без внутренностей, упитанностью по Фультону и по Кларк. Индивидуальная относительная плодовитость колеблется от 36 до 103 икринок на грамм массы тела и коррелирует с общей массой рыб и упитанностью по Фультону. При этом показатели воспроизводительной способности пеляди существенно различаются в разные годы. В целом в настоящее время индивидуальная относительная плодовитость данного вида в возрастных группах 5+ и старше по сравнению с серединой ХХ века снизилось на 41–47 %. Отмечена связь воспроизводительной способности пеляди, поднимающейся на нерест в Среднюю Обь, с температурой среды в Нижней Оби, где происходит нагул производителей перед началом нерестовой миграции – относительно высокие температуры июля ассоциированы с более низкими показателями ИАП наиболее многочисленных возрастных групп. Таким образом, потепление климата может отрицательно сказаться на воспроизводительной способности пеляди в бассейне Оби.
Nanozinc as an emerging nanopollutant: sublethal effects on the invasive freshwater bivalve Limnoperna fortunei (Dunker, 1857)
Zinc oxide nanoparticles (ZnONP) are among the most widely produced nanomaterials worldwide given their unique properties, despite their nanotoxicity has been poorly addressed. In parallel, environmental concern has risen because of increasing amounts of them reaching the environmental matrices, whereas the aquatic ones are one of the main final sinks. As key non-target species, we aimed to expose the invasive freshwater bivalve Limnoperna fortunei to sublethal concentrations of ZnONP (0, 0.025, 0.25, and 2.5 mg/L) to evaluate tissue damage and oxidative stress-related markers in the soft tissue. After a 96 h-exposure, the alkaline phosphatase enzyme activity increased after 0.025 mg/L, and the alanine aminotransferase activity decreased at 2.5 mg/L. Aspartate aminotransferase enzyme activity also decreased at 0.25 and 2.5 mg/L. In terms of oxidative stress, only superoxide dismutase activity increased after exposure to the lowest nanozinc concentration. We concluded that nanozinc may pose a threat to the aquatic biota in a context that lacks proper regulation and control for nanopollutants, and that the toxicity mechanisms in this species are mainly related to tissue damage, even at environmentally relevant concentrations, as the lowest one tested.
Моделирование таяния с использованием простой и улучшенной температурно-индексных моделей: тестирование для Сыгыктинского ледника, хребет Кодар (Забайкалье, Россия)
Моделирование таяния снега и льда в речных бассейнах позволяет существенно улучшить прогнозирование гидрологических процессов в локальном и региональном масштабах. Скорость таяния на поверхности Сыгыктинского ледника (хребет Кодар, северное Забайкалье) была измерена ультразвуковым датчиком, а также рассчитана на основе физически обоснованной модели поверхностного энергетического баланса (SEB) с 30-минутным разрешением за период с 7 июля по 23 августа 2021 г. Для расчета таяния были протестированы две Т-индексные модели, простая (TM) и усовершенствованная (ETM). Все модели использовали данные 30-минутных метеорологических измерений с помощью автоматической метеостанции, установленной в средней части ледника на высоте многолетней границы питания (2561 м). Эффективность Т-индексных моделей была оценена с помощью сравнения 30-минутных скоростей таяния с физически обоснованной моделью SEB. Модель TM использует в качестве предиктора температуру воздуха объясняет до 30% изменчивости таяния. В то же время модель ETM, учитывающая кроме температуры также приходящую коротковолновую радиацию и альбедо, показала намного лучшую эффективность и объяснила до 90% изменчивости в эталонной скорости таяния ледника. Преимущества усовершенствованной модели позволяют использовать ее в дальнейшем при пространственном моделировании таяния ледников Кодара.
Термогидродинамические процессы в Ладожском озере: верификация 3D модели
Представлены результаты адаптации к условиям Ладожского озера трехмерной математической модели гидродинамики внутреннего моря с последующей ее верификацией по данным натурных и дистанционных измерений. При адаптации построена сферическая расчетная сетка типа B с пространственным разрешением 1км×1км. Уравнение состояния морской воды заменено на уравнение слабоминерализованной воды с максимумом плотности при температуре, близкой к 4 °С. Реализована процедура расчета поступления тепла и растворенных веществ в озеро через жидкие границы с водами притоков. Учтен сток реки Невы. Атмосферный форсинг из реанализа NCEP/NCAR с пространственным разрешением 2,5°×2,5° заменен на европейский аналог ERA5 с разрешением 0,25°×0,25°. Верификация новой версии модели выполнена для трех районов озера - южного мелководного (≤ 40 м), центрального (~50 м) и северного глубоководного с глубинами до 230 м. Для оценки влияния климатических изменений на термогидродинамические процессы расчеты проводились с 1990 по 2020 г. Для верификации использовались как данные контактных измерений Института озероведения РАН, так и снимки со спутников NOAA и MODIS Terra/Aqua. Результаты верификации показали, что модель адекватно воспроизводит основные особенности термогидродинамических процессов в Ладожском озере, а именно: вертикальную термическую структуру водной массы озера, начало формирования и распространения вертикальной фронтальной зоны - термобара. Учет вод притоков позволяет проследить их дальнейшее распространение в озере. Замена атмосферного форсинга привела к значительному улучшению расчетов ледовой обстановки в озере. Результаты верификации новой версии модели следует признать удовлетворительными. Также отмечены и недостатки модели.
Пространственные и временные различия в развитии видов Ulnaria danica, Ulnaria acus и Fragilaria radians в озере Байкал
Оценка разнообразия фитопланктона в пресноводных водоемах сильно зависит от методов, используемых при таксономической идентификации. Бесшовные диатомовые водоросли из родов Ulnaria (Kützing) Compère и Fragilaria Kützing доминируют в составе фитопланктона в пресноводных экосистемах. Применение комплексного подхода, включающего метабаркодирование с использованием анализа фрагментов V3-V4 региона 18S рРНК, световой и сканирующей электронной микроскопии, позволило провести оценку различий в распределении этих видов в оз. Байкал. Показано, что в 2017 году Южной и Средней части оз. Байкал происходит постепенная смена исследуемых видов, что обусловлено тем, что пик развития Fragilaria radians опережает Ulnaria acus. В период гидрологической весны пелагической зоне озера в этих районах, в Чивыркуйском и Баргузинском заливах среди диатомей доминировала U. acus. Развитие популяции в Северной части озера не соответствовало выявленным тенденциям, согласно которым в конце весны здесь следовало ожидать высокую численность обоих видов, однако она не превышала 3% от общей численности. В летний период численность U. acus значительно снижалась и достигала своего минимума осенью. Ulnaria danica представлена в фитопланктоне крупных заливов в течении всего периода исследования.
Bioactivities of freshwater sponges and their associated bacteria: a review
This review aims to provide an overview of the biological activities of freshwater sponges and their microbes associated with them. Freshwater sponges, despite their ecological significance and potential as reservoirs of bioactive compounds, remain underexplored compared to their marine counterparts. This review highlights the bioactivities of eight freshwater sponge extracts, among them being Ochridaspongia rotunda (Arndt,1937), Ephydatia fluviatilis (Linnaeus,1759), Oncosclera asiatica (Manconi & Ruengsawan,2012), Metania reticulata (Bowerbank,1863), Drulia browni (Bowerbank,1863), Drulia cristata (Weltner,1895), Drulia uruguayensis (Bonetto & Ezcurra de Drago,1969), and Eunapius carteri (Bowerbank,1863).Various extracts, including those obtained using methanol, acetone, aqueous, ethyl acetate, and methylene chloride, were employed in previous studies to evaluate a range of bioactivities. Observed bioactivities include antibacterial, antifungal, anti-quorum sensing, antiplasmodial, acetylcholinesterase inhibition, and anticancer properties, which are determined either from the crude extracts of the sponges themselves or by their associated microbes.